生物信息学(Bioinformatics)是一门利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题的学科,侧重于生物学领域中计算方法的使用和发展。目前的生物信息学基本上只是分子生物学与信息技术(尤其是互联网技术)的结合体。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据,其研究工具是计算机,研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟)。目前主要的研究方向有:序列比对、基因识别、基因重组、蛋白质结构预测、基因表达、蛋白质反应的预测,以及建立进化模型。*(1)
生物学技术往往生成大量的嘈杂数据。与数据挖掘类似,生物信息学利用数学工具从大量数据中提取有用的生物学信息。生物信息学所要处理的典型问题包括:重新组装在霰弹枪定序法测序过程中被打散的DNA序列,从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构,利用mRNA微阵列或质谱仪的数据检验基因调控的假说。
生物信息学与计算生物学
有些人将计算生物学作为生物信息学的同义词处理;但也有些人认为计算生物学和生物信息学应当被当作不同的条目处理,因为生物信息学更侧重于生物学领域中计算方法的使用和发展,而计算生物学强调应用信息学技术对生物学领域中的假说进行检验,并尝试发展新的理论。
注:右表排名为2014年USNEWS遗传学、基因组学及生物信息学排名,医学家不包括流行病专家的薪水。
大学排名
排名 | 学校中文名 | 英文名 | 州/地区 |
1 | Stanford University | Stanford, CA | |
2 | Massachusetts Institute of Technology | Cambridge, MA | |
3 | Harvard University | Boston, MA | |
4 | University of California–Berkeley | Berkeley, CA | |
5 | University of Washington | Seattle, WA | |
5 | Washington University in St. Louis | St. Louis, MO | |
7 | Johns Hopkins University | Baltimore, MD | |
8 | 加州大学旧金山分校 | University of California–San Francisco | San Francisco, CA |
8 | Yale University | New Haven, CT | |
10 | Princeton, NJ |
注:以上排名为2014年USNEWS遗传学、基因组学及生物信息学排名
参考资料:
(1) Molecular genetics Wikipedia
(2) Biological Scientists, All Other US Bureau of Labor Statistics
(3) Best Genetics / Genomics / Bioinformatics Program 2013-2014 USNEWS
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